Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc12Q8R344 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms