Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms