Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trpt1Q8K3A2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpt1Q8K3A2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpt1Q8K3A2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms