Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nsl1Q8K305 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nsl1Q8K305 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms