Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Depp1Q8K2F3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Depp1Q8K2F3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms