Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkd3Q8K1Y2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkd3Q8K1Y2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms