Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem17Q8K0U3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem17Q8K0U3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.3 ms