Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l2Q8JZQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l2Q8JZQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms