Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip3Q8CHD8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms