Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Usp27Q8CEG8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Usp27Q8CEG8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Usp27Q8CEG8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Usp27Q8CEG8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp27Q8CEG8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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