Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrrc9Q8CDN9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrrc9Q8CDN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms