Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6030452D12RikQ8CD33 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms