Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps53Q8CCB4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms