Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pm20d1Q8C165 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pm20d1Q8C165 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pm20d1Q8C165 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pm20d1Q8C165 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pm20d1Q8C165 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms