Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp47Q8BY87 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp47Q8BY87 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp47Q8BY87 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms