Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr4Q8BUD0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpr4Q8BUD0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms