Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt2aQ8BNV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt2aQ8BNV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt2aQ8BNV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms