Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gcfc2Q8BKT3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcfc2Q8BKT3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcfc2Q8BKT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms