Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rufy1Q8BIJ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rufy1Q8BIJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms