Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms