Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnb1Q8BG40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms