Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms