Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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