Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zer1Q80ZJ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zer1Q80ZJ6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zer1Q80ZJ6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms