Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ClspnQ80YR7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ClspnQ80YR7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ClspnQ80YR7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms