Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8Q80YR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp8Q80YR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms