Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms