Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms