Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn1Q7TPR4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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