Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd1l2Q7TN88 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms