Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms