Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1cQ76I25 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms