Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv1Q704Y3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv1Q704Y3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms