Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx55Q6ZPL9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx55Q6ZPL9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx55Q6ZPL9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms