Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2oQ6ZPJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube2oQ6ZPJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms