Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfap2eQ6VUP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms