Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc88cQ6VGS5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms