Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja6Q6S5G4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja6Q6S5G4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms