Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrm2bQ6PEE3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms