Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtminQ6P9S1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtminQ6P9S1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.7 ms