Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms