Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Caskin1Q6P9K8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Caskin1Q6P9K8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Caskin1Q6P9K8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms