Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp12Q6P5B0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp12Q6P5B0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms