Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podnl1Q6P3Y9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podnl1Q6P3Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Podnl1Q6P3Y9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms