Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc66Q6NS45 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms