Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CltbQ6IRU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms