Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Best3Q6H1V1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms