Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Swap70Q6A028 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swap70Q6A028 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms