Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc8eQ66JT1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc8eQ66JT1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms