Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja3Q64448 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms